La storia di Saint Seiya: la morte e il relife è un antico mito di una giovane donna che si sacrifica per l'amore di un uomo mortale. In questo mito, una ragazza di nome Aiolia è nata e cresciuta per essere un grande guerriero. Ma è stata abusata da sua madre, Saori. Quando era un bambino, credeva che sua madre fosse una strega, ma ora è determinata a salvare sua sorella e la sua vita. La serie segue il viaggio di Saint Seiya e dei suoi amici mentre cercano la tomba dei Papi.
Mentre la serie si svolge, Atena è Trafiggens di Dio Hades, un demone che è diventato un demone. I due si uniscono all'altro cosmo e trovano la salvezza. Come combattono, incontrano molte sfide sfidanti. Dopo la loro sconfitta, Atena è rinata come un essere umano, dove lei e gli altri Cavalieri devono trovare una Strada per la salvezza.
Il gioco inizia con un video all'inizio in cui Seiya scopre che sua sorella Seika è scomparsa. Dopo averla trovata, si dirige verso il tempio di Poseidone e si prepara a sparare una freccia d'oro al dio del tempo. Mentre la serie progredisce, impara che sua sorella è viva e sicura. Una nuova sfida è presentata quando è tradita da Phoenix Ikki, che desidera vendicarsi per la sua formazione.
